Alternativa B está correta
Os equipamentos contadores de produção deverão ser instalados em todas as linhas de produção existentes nos estabelecimentos industriais fabricantes de cigarros, em local correspondente ao da aplicação do selo de controle.

A legislação do IPI aplicável aos fabricantes de cigarros (RIPI e instrução normativa específica) determina que os contadores de produção sejam instalados em todas as linhas de produção, no local correspondente à aplicação do selo de controle — garantindo assim que cada unidade produzida seja contabilizada no ponto de controle fiscal. A obrigatoriedade é universal para todas as linhas, sem exceção.

Por que as outras estão erradas:
A) Todos os fabricantes de cigarros são obrigados à instalação de contadores de produção — não há exceção para aqueles que instalam equipamento de controle e rastreamento. Os dois sistemas podem coexistir, mas o contador é sempre obrigatório.
C) No caso de avaria, o prazo para conserto é de 72 horas (não 30 dias), sendo obrigatório o uso do selo de controle durante a interrupção — o prazo de 30 dias descrito na alternativa está incorreto.
D) Os equipamentos contadores de produção, em condições normais de operação, não deverão permanecer acessíveis para configuração ou interação manual, justamente para evitar manipulações — a alternativa inverte a exigência de inviolabilidade do equipamento.
E) A obrigatoriedade de contadores de produção alcança todos os fabricantes de cigarros, independentemente de possuírem outros aparelhos de controle — não há essa distinção na lei.