Alternativa B está correta
O segmento “respectivamente nessa ordem” é redundante, pois o advérbio “respectivamente” já indica a mesma ordem de termos anteriores.
O termo “respectivamente” já serve para indicar que os itens listados seguem a ordem em que foram mencionados os “três momentos”, tornando o complemento “nessa ordem” desnecessário.

Por que as outras estão erradas:
A) A substituição por apenas uma vírgula poderia comprometer a fluidez ou a conexão lógica entre os termos “momentos” e os exemplos.
C) O termo “nossa terra” é uma marca de inclusividade autoral/nacionalista comum, mas não limita o público a “brasileiros natos”.
D) O segmento quantifica (“boa parte”), mas não necessariamente “qualifica” a exploração no sentido técnico ou adjetivado.
E) O antecedente é o período do descobrimento e envio de riquezas, mas o termo “Brasil-Colônia” atua como uma nomeação histórica, não apenas uma referência anafórica simples.